2022年7月19日,云中新型计算研究实验室开发商Code Ocean发布免费研究网站开放科学图书馆(Open Science Library, OSL),用于发布和复制来自某些国家的计算研究领域世界领先的期刊和独立研究人员的科研成果。目前,OSL包含3000多个已发布的计算实验,这些实验可以在Amazon Web Services (AWS)上启动、复制以供进一步研究,或完全导出以在本地计算环境中运行。此外,OSL还为团队提供协作空间,迄今为止可以与40000多个项目一起工作。

图片来源:https://codeocean.com/explore
任何通过Nature、IEEE、Elsevier等期刊发表文章的科学开发人员和作者都可以使用OSL。平台所收录的计算代码包括生物信息学、化学、计算机科学、地球科学、经济学、数学、物理学、社会科学等学科的研究领域。
Code Ocean联合创始人兼首席执行官Simon Adar说到:“计算科学的代码不容易获得,但通过借助OSL,科学家们可以在传统期刊出版物发布复制计算实验和结果所需的所有代码和数据。”
OSL平台每天拥有数百名用户,最近发布的Compute Capsule总数已超过3000个。Code Ocean的Compute Capsule是一种卓越的新型科学容器技术,它封装了计算实验的可重现、存档和可执行版本。Capsule结合了任何计算研究工作的基本三元组:代码、数据和计算环境。Compute Capsule建立在FAIR原则之上,允许跨平台轻松迁移代码和数据。
大多数科学都不容易获得,因为它通常需要获取必要的源代码、匹配所需的包并构建应用程序。对于大多数科学家来说,OSL 使构建新科学变得更加实用,因为 Code Ocean平台以即用型、现成的格式提供计算代码。Code Ocean为研究人员提供长达10小时的免费AWS时间,用于开发、测试和可重复运行已发布的Capsule。在Nature、IEEE和AACR期刊上发表论文的科学家将没有计算小时数限制。
OSL由两个组件组成——发布实验的可执行版本的能力,允许其他人在近期甚至几年后回来在云中无缝地运行相同的实验。Open Science Workbench使研究人员能够设计实验、发布代码并向全世界发布,所有这些都由Code Ocean维护。最重要的是,这不是档案,而是可以像使用传统图书馆一样“签出”内容。
Code Ocean最近还宣布了Code Ocean计算实验室的2.0 版,这是一个面向计算科学家的新数字实验室。它是第一个结合工作流管道以及针对编码科学家的数据科学探索性工作的平台。借助2.0版,计算科学家可以在简化的自动化实验室中创建、组织和共享计算研究。通过消灭开支任务和简化协作,计算科学家可以专注于科学。随着在生物制药领域的广泛应用,Code Ocean数字实验室在加速科学和降低研究成本方面的价值也已经证明。
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