为了提供关于 PLOS 期刊如何支持开放科学最佳实践的更丰富、更透明的信息,PLOS将开始发布在 PLOS 文章中观察到的“开放科学指标”数据。对于 2019 年至今的所有 PLOS 文章,这些开放科学指标最初将包括 (i) 存储库中研究数据的共享;(ii) 代码的公开共享和 (iii) 预印本发布。这些指标——由 PLOS 概念化并使用 DataSeer 开发,使用人工智能驱动的方法。PLOS计划公开分享结果,以支持更广泛社区的开放科学计划。
PLOS 自成立以来一直是开放科学实践的支持者,在 2014 年引入了增强的数据可用性政策。自 2020 年以来,PLOS建立了一项新的活动计划——开放研究解决方案计划。其目标是显著增加多种开放科学实践的采用。为支持该目标,引入共享协议、代码、研究数据和预印本的新解决方案。
作为实现这一目标的先决条件,PLOS需要更好地理解所服务的研究人员的需求和实践。这意味着PLOS需要定期调查:
采用开放科学实践的水平和趋势如何?
采用开放科学实践的潜力是什么?
PLOS与社区共同创建的解决方案有什么影响?
开放科学实践在学科和地区之间有何不同(以及为什么)?
采用的障碍是什么?哪些解决方案可以支持采用?
PLOS需要在日益多样化的社区中回答这些问题,用于日益多样化的研究成果。大规模测量开放科学实践不能手动完成。为此,今年早些时候,PLOS与 DataSeer 分享了成功试点的结果,以测量PLOS Computational Biology的代码共享率。除了展示期刊强制代码共享政策在提高代码可用性方面的有效性外,该试点还展示了 DataSeer 的自然语言处理和人工智能驱动技术在有效评估 PLOS 内容中的开放科学实践方面的有效性。
PLOS扩大了与 DataSeer 的合作伙伴关系,DataSeer 正在帮助创建和提供包含三个开放科学指标的初始套件,这将有助于了解开放科学如何从2019年起在所有PLOS内容中实践。之后,将为所有 PLOS 研究文章分享开放科学最佳实践的3个指标,这些指标在公共科学图书馆的期刊中大部分是可选的:
数据存储库中的数据共享率
代码共享率
出版前在任何预印本服务器中的预印本发布率
这些开放科学指标的模型如图 1 所示(这些是初步结果,可能会发生变化):
图1
在与 DataSeer 合作衡量代码共享后,现在正在开发检测作为预印本发布的 PLOS 文章的能力。虽然 PLOS对集成预印本服务器(bioRxiv 和 medRxiv)的使用有深入的了解,但对其他预印本服务器的使用情况了解并不完整。随着产品组合扩展到新的研究社区,特别是生物学和医学之外,PLOS需要支持更多其他领域的研究人员。
PLOS不会止步于 PLOS 的内容上,因此,还需要了解这些指标如何与 PLOS 之外的相关内容进行比较。因此,PLOS的方法将包括在PubMed Central的开放获取文章的主题匹配的随机样本中评估相同的开放科学指标。随着时间的推移,PLOS对跨学科和跨社区采用开放科学的了解越多,就有越多的知识来为支持研究者需求和开放科学实践的解决方案的共同创造提供信息。
PLOS将成为第一个以透明共享的方式公开开放科学指标的出版商,并且会持续这样做,即指标将在发布后定期更新,以展示随时间推移的变化趋势。
重要的是,该指标并不是为期刊、个人、资助者或机构创建新的“指标”或“排名”。开放科学指标是开放科学实践的指标。但是,当与定性见解和其他负责任地使用的指标相结合时,开放科学指标可以帮助更全面地了解研究的影响和可信度。许多倡议都强调了这一点,例如在欧盟委员会、联合国教科文组织、HELIOS、FOLEC和DORA,其目标是更好地识别开放科学在研究评估方面的实践。PLOS认为这些指标可以中立地衡量开放科学实践并及激励这些实践。
PLOS目前正在准备在 2022 年晚些时候发布数据的第一个主要版本。这些数据会在开放许可下可供重复使用。
在第一次数据发布后,研究数据、代码和预印本的指标将随着新的 PLOS 内容的发布而定期更新。PLOS还将与 DataSeer 合作开发其他开放科学指标。以协议的形式共享详细的方法信息是PLOS最近关注的另一个开放科学实践,为这个实践创建一个适当的指标是下一步的路线图。
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https://theplosblog.plos.org/2022/09/plos-partners-with-dataseer-to-develop-open-science-indicators/